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單細胞可視化分選系統——isoPick
isoPick是英國iotaSciences公司新推出的一款基于GRID專利技術(專利號:WO2019197373A1 )、高通量、高自動化的單細胞可視化分選系統。isoPick采用微射流技術,利用界面張力對細胞培養基(或干細胞涂層)進行重塑,在培養皿上雕刻出單獨的細胞腔室GRID。isoPick可以在 6 厘米培養皿上創建 256 個單細胞腔室GRID陣列,并將細胞以納升體積全自動地分配到各個 GRID 單細胞腔室中,通過isoPick的光學顯微鏡可以清楚地看到 GRID 室中的單細胞。基于GRID技術和光學成像信息,isoPick可以確保分選出的細胞100%為單細胞。
應用領域
①單細胞分選:100%準確的單細胞分選效率
傳統單細胞分選方法無法保證所得的樣品中只有一個單細胞,而isoPick采用GRID單細胞腔室分離與光學信號驗證相結合的分選技術,能夠保證分選所得的單細胞樣品中只有一個單細胞。
單細胞分選前后的GRID細胞腔室
② 單細胞組學:極大地簡化單細胞組學步驟
isoPick可以將1.5~200 µl的單細胞樣品直接轉移至PCR管帶或96孔板中,無縫銜接后續單細胞測序scWGA流程,極大地簡化單細胞組學步驟。
單細胞的WGA結果
設備特點
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全自動化流程
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操作簡單,對細胞無損傷
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結果可追蹤
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分離效率高達100%
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直接轉移到PCR管或96孔板
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結構緊湊,體積小
isoPick:自動化單細胞挑選利器
傳統單細胞分離手段無法保證所得的樣品內只有一個單細胞,有可能有多個細胞或細胞團,導致下游的實驗出現誤差。isoPick采用的GRID技術結合圖像信息分析,可將細胞懸液(每毫升約15000個細胞)自動轉移到GRID腔室中,然后可視化地在每個GRID腔室中確定是否是單個細胞,保證了100%準確的單細胞分選率。根據保存的位置坐標,isoPick系統自動將單個細胞分配到預定的位置(如96孔板或PCR管中),無縫銜接單細胞下游應用,確保后續單細胞組學信息完整性。整個分選過程溫和,顯著提高了細胞的存活率。
應用案例
單細胞脂質組學新突破!打破傳統困境,驅動高效精準全鏈路分析
在生命科學的廣闊領域中,單細胞分析技術正以超高的精度揭示著生命的奧秘。一篇題為《Single-Cell Lipidomics - An Automated and Accessible Microfluidic Workflow Validated by Capillary Sampling》的文章在單細胞脂質組學研究領域引起了廣泛關注。文中使用的單細胞可視化分選系統—isopick解決了微流控技術表征脂質組學時面臨的一系列難題,可以實現高通量、高自動化的單個活細胞分離。同時,該技術與液相色譜-質譜還具有良好的兼容性,讓本實驗從細胞培養—單細胞精準分選—單個活細胞中的脂質測量全鏈路成為可能,為單細胞脂質組學分析技術開辟全新通路,推動該領域邁向準確化、高效化、智能化新紀元。
研究人員利用isopick平臺,結合微流控技術,構建了一個自動化的單細胞脂質組學工作流程。通過優化各項參數,如使用無胎牛血清的培養基、稀釋的人源白蛋白緩沖液以及以磷酸鹽緩沖液(PBS)進行細胞分配等,顯著提高了脂質檢測的效率和準確性。與傳統的毛細管采樣方法相比,優化后的微流控方法不僅保持了相似的脂質檢測性能,還大幅提高了采樣速度,使得整個工作流程更加高效、便捷。
測試數據
K562細胞單細胞測序
傳統單細胞測序需對單細胞進行全基因組擴增(WGA),但傳統單細胞WGA受限于如何獲得單個細胞并轉移到小體積的WGA反應中。
使用isoPick自動將K562細胞拾取并轉移至含3.5 µl scWGA試劑的PCR管中,并無縫銜接scWGA反應。瓊脂糖凝膠電泳結果顯示(下圖),單細胞WGA的DNA樣本(+)中兩種基因均被特異性擴增,而陰性對照(-)沒有這兩種擴增產物,符合預期。
發表文章
單細胞可視化分選系統已發表于Cell、Advanced Science、Small Methods、Nature Communications等著名期刊,如下為具有代表性的文獻:
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Soitu C, Stovall‐Kurtz N, Deroy C, et al. Jet‐Printing Microfluidic Devices on Demand[J]. Advanced Science, 2020, 7(23): 2001854.
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Gangoso E, Southgate B, Bradley L, et al. Glioblastomas acquire myeloid-affiliated transcriptional programs via epigenetic immunoediting to elicit immune evasion[J]. Cell, 2021, 184(9): 2454-2470. e26.
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Deroy C, Nebuloni F, Cook P R, et al. Microfluidics on Standard Petri Dishes for Bioscientists[J]. Small Methods, 2021, 5(11): 2100724.
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Deroy C, Wheeler J H R, Rumianek A N, et al. Reconfigurable microfluidic circuits for isolating and retrieving cells of interest[J]. ACS Applied Materials & Interfaces, 2022, 14(22): 25209-25219.
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Oliveira N M, Wheeler J H R, Deroy C, et al. Suicidal chemotaxis in bacteria[J]. Nature Communications, 2022, 13(1): 7608.
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