動物機體受到內在或外界致病因素和不利影響的作用而產生的一系列損傷與抗損傷的復雜過程，表現為局部、器官、系統或全身的形態變化和(或)功能障礙。在健康情況下，動物與其環境之間保持一種動態平衡，機體的結構和功能處于正常狀態；疾病則使這種平衡受到破壞。在這一過程中，若損傷大于機體的防御能力，則疾病惡化，甚至導致死亡；反之則疾病*，機體康復，間或某些不良后果。
1、根據疾病性質的分類：
傳染病：其病原包括病毒、細菌、立克次氏體、衣原體、霉形體和真菌等微生物。特點是：①每一種傳染病都由一種特定的微生物所引起，而且宿主譜寬窄各不相同。如和分別是由豬瘟病毒和炭疽桿菌所引起的；豬瘟只能感染豬屬動物，而炭疽則幾乎能感染所有哺乳動物，包括人類。②具有傳染性。病原微生物能通過直接接觸(舐、咬、交配等)，間接接觸（空氣、飲水、授精精液等），死物媒介（畜舍用具、污染的手術器械等），活體媒介（節肢動物、嚙齒動物、飛禽、人類等）從受感染的動物傳于健康動物，引起同樣疾病。③分別侵害一定的器官、系統甚或全身，表現*的病理變化和臨診癥狀。④動物受感染后多能產生免疫生物學反應（免疫性和變態反應），人類可借此創造各種方法來進行傳染病的診斷、治療和預防。
寄生蟲病：寄生蟲主要包括原蟲、蠕蟲和節肢動物3大類。前二者多為內寄生蟲,后者絕大多數為外寄生蟲。寄生蟲多有較長的發育期和較復雜的生活史，有的需要在一種、甚至幾種宿主體內完成其發育，多數寄生蟲都有其固定的終宿主它們可以通過直接接觸(如疥螨、馬媾疫錐蟲、鉤蟲絲狀蚴、血吸蟲尾蚴),吞入含感染性蟲卵、幼蟲或卵囊等的土壤、飲水或飼料（例如蛔蟲、圓線蟲、球蟲）以及蜱、虻等外寄生蟲作媒介（例如血液原蟲）而傳播。
普通病：主要包括內科、外科和產科疾病3類。內科疾病有、神經、心血管、造血器官、內分泌、肌肉、骨骼等系統以及營養代謝、中毒、遺傳、免疫、幼畜疾病等，其病因和表現多種多樣。外科疾病主要有外傷、等。產科疾病可根據其發生時期分為懷孕期疾病（死胎等），分娩期疾病，產后期疾病以及乳房疾病、新生幼畜疾病等。
但上述分類并非的。有些原蟲所致的疾病如、和等由于傳播、流行和表現方式與傳染病非常相似，有些學者也將其歸入傳染病。由蟠尾絲蟲侵害馬項韌帶所致的甲瘺，既是一種寄生蟲病，又可歸屬于外科病。之能用手術切除者屬于外科疾病，非手術所能達到者為內科疾病。至于因重視幼畜的培育及強調幼畜的解剖生理特點而設置的幼畜病分支，其內容則傳染病、寄生蟲病和普通病三類俱備。分類為便于敘述和應用，并無不可逾越的界限。
2、根據同時發病動物多少的分類：
可分為群發病和散發病兩類，一般傳染病、寄生蟲病、中毒和營養缺乏病多為群發，但也有例外，如破傷風雖為一種傳染病，但必需有破傷風梭菌存在于的深中才能發生，故僅散發。有些傳染病如以及部分寄生蟲病，如弓形蟲病和血吸蟲病在畜群中常表現為隱性感染，多屬散發，僅偶有群發。在群發疾病中，又可根據其流行方式分為地方性、流行性和大流行性疾病。普通病雖多為散發，但某些中毒疾病和營養缺乏、特別是微量元素缺乏疾病，由于其病因多與某一地區飼料和土壤的特性有關，亦常呈地方性流行。在傳染病和寄生蟲病中，有的因其病原(例如炭疽桿菌、惡性水腫梭菌及其芽孢)常存在于某一地區的土壤中，或者其中間宿主（如含血吸蟲尾蚴的螺、帶梨形蟲的蜱）只限于某一水域或者地區中，所以只呈地方性流行。但大多數烈性傳染病如、豬瘟、等常同時在廣大地區蔓延發生，以流行性疾病著稱；其中部分尚可同時迅速在洲際散播，構成大流行或世界性流行。
2、其他分類：
動物疾病還可分為本土疾病和外來疾病。在交往頻繁,旅游和貿易十分發達的情況下,外來疾病常通過各種交通工具中的蚊、蠅、蚤、虱、臭蟲、蟑螂、老鼠和伴隨動物、進口的家畜和野獸、冷凍精液和胚胎，以及畜產品和其他貨物傳入本國。嚴防外來的動物疾病，已成為國境和口岸檢疫的重要任務。
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