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Paxgene采集管在妊娠期間細胞動態的檢測中的應用
閱讀：802發布時間：2023-10-27
人類血液是分子信息的豐富來源，可用于開發特定腫瘤和器官（例如胎盤）的非侵入性液體活檢，以預測疾病、其進展和對治療的反應。近年來，隨著微陣列和RNA測序（RNA-Seq）等技術的普及，全基因組轉錄組分析被應用于發現分子標記，這些技術允許同時測量數以萬計的蛋白質編碼和非蛋白質。開發血液轉錄組標記物以監測整個懷孕期間的胎盤功能和產科并發癥的風險需要準確量化基因表達。
來自美國韋恩大學醫學院和密歇根州立大學的研究團隊在Nature子刊Scientific Reports發表了題為“Targeted expression profiling by RNA - Seq improves detection of cellular dynamics during pregnancy and identifies a role for T cells in term parturition"的文章，比較了在外顯子水平探測轉錄組的Affymetrix人類轉錄組陣列（HTA 2.0）、具有珠蛋白還原的配對末端Illumina RNA-Seq以及一種新型全基因組靶向表達分析技術 DriverMap，評估了這些方法在母體全血中定量源自胎盤單細胞基因組的細胞類型特異性特征表達的能力，并確定了這些特征是否能表明足月分娩。
由于器官和/或細胞類型特異性轉錄本在全血中低表達，因此RNA的完整性、穩定性和RNA的豐度定量對下游實驗至關重要。本研究中使用的血液RNA采血管是PAXgene全血RNA管（BD，762165），該管中含有穩定添加劑，可長時間維持細胞 RNA 完整性。
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