顯色培養基一般是在分離培養基中加入檢測某些菌種的特異性酶底物。該底物由產色基團和微生物可代謝物質組成，通常為無色。但在特異性酶作用下游離出發色基團并顯示一定顏色，直接觀察菌落顏色即可對菌種做出鑒定。
用顯色培養基鑒定微生物是在生化反應的基礎上開發的新技術。其原理是將微生物胞內酶的種類及反應條件作為微生物分類鑒定的主要依據, 通過在分離培養基中加入微生物特異性酶的底物, 該底物由發色基團和微生物可代謝物質組成, 通常無色, 但在特異性酶作用下游離出發色基團并顯示一定顏色, 直接觀察菌落顏色就可對菌種做出鑒定, 減少了對菌株進行純培養和進一步生化鑒定的步驟 。
原理：一是利用某個菌屬胞漿中含有的特異性的酶。該酶越是只有這種菌含有，利用該酶來進行鑒定的準確度就越高，特異性就越強。在顯色培養基中加入該酶的特異性顯色底物，當大量生長這種菌時，顯色底物滲入到細菌體內，被酶裂解，就會產生顏色，從而使菌落也帶上顏色。二是在顯色培養基中加入抗生素或膽鹽混合物，抑制其他無關菌的生長，即提高了選擇性，或者是調整培養基中的營養，是一些無關菌因為缺少營養而不能生長，而目標菌的營養在該顯色培養基中能被滿足，因此能夠生長。
顯色培養基的特點：
①顯色培養基配制簡單，孵育后可直接觀察結果，省去了傳統方法 對菌株進行純培養和進一步生化鑒定的步驟。大的縮短了鑒定時間，省時省力，利于操作流程的標準化。
②在自然環境中，顯色培養基可對不同微生物個體，特別是對混合生長的多種微生物，進行檢測和鑒定，靈敏度遠高于傳統方法。節約時間，提高效率。
③有些配方的顯色培養基，加有抑制雜菌生長的物質，因而大的提高了培養基的特異性，讓檢測鑒定工作變得更簡單。
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