真空冷凍干燥機的工作原理是將干燥后的物品冷凍到三相點溫度以下，然后在真空條件下將物品中的固體水（冰）直接升華成水蒸氣，從物品中取出，使其干燥。物料經預處理后進入速凍倉冷凍，再進入干燥倉升華脫水，后處理車間包裝。
真空冷凍干燥技術主要應用于：
(1) 藥品在低溫下干燥，不會產生變性或失去生物活性，熱穩定性差的生物制品，生化類制品，血液制品，基因工程類制品等藥物凍干如脂質體，蛋白質藥物、疫苗、菌種、血液制品的保存特別適用；
(2) 為保持生物組織結構和活性，外科手術用的皮層、骨骼、角膜、心瓣膜等生物組織的處理，活體組織在移植時，離體不能超過24小時；
(3) 以保持食物色、香、味和營養成分以及能迅速復水的咖啡、調料、肉類、海產品、果蔬的凍干；
(4) 在微膠囊制備、藥品緩控釋放材料等方面的應用。 以保持生鮮物質不變性的人參、蜂皇漿、龜鱉等保健品及中草藥制劑的加工；
(5) 超微細粉末功能材料如：光導纖維、超導材料、微波介質材料、磁粉以及能加速反應工程的催化劑的處理等。
在使用時須注意下面這些事項：
1、真空泵累計工作時間達到200小時或者真空泵油顏色變成褐色時，須更換真空泵泵油。
2、干燥機使用環境溫濕度應保持在10℃-30℃之間，相對濕度要≤80%。
3、設備與墻壁的距離應大于30cm，工作環境應無導電粉塵、爆炸性、腐蝕性氣體和強電磁場干擾。
4、注意凍干機通風緩慢。在微通氣閥旋轉1/2-3/4圈后，你可以感覺到手指的一點點。嚴禁瞬間打開微通風閥，損壞真空傳感器。
5、請勿頻繁開關總電源和制冷機，制冷機停電后再啟動少需要等待3分鐘。
6、關機時，應先充氣，然后關閉真空泵，防止真空泵返油污染樣品。
7、有機玻璃蓋與主機采用硅膠密封圈密封。密封圈應保持清潔，以防劃傷和損壞。有機玻璃蓋不得用有機溶劑擦拭。
8、凍干機使用完，請把冷阱水分及冷阱阱口水分擦拭干凈。
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