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mRNA-LNP疫苗制備流程與免疫評價實驗方案分享

時間:2025/2/14閱讀:314
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隨著生物技術的飛速發展,mRNA疫苗作為一種新型疫苗技術,憑借其特定的優勢在疾病預防和治療領域展現出巨大的潛力。本文將詳細介紹一種針對特定抗原序列的mRNA脂質納米顆粒(LNP)疫苗的開發流程,以及在小鼠模型中評估其免疫效率的實驗方案。該方案涵蓋了從mRNA序列設計、合成、LNP封裝到小鼠免疫的全過程,并包括了關鍵的質量控制檢測和免疫反應評估技術。"


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1

mRNA序列設計

mRNA疫苗的核心是其序列設計。本研究中使用的mRNA序列包含5'非翻譯區(UTR)、編碼5種抗原的序列、GFP報告基因、3'UTR以及聚腺苷酸(PolyA)尾。5'和3'UTR序列對于mRNA的穩定性和翻譯效率至關重要,通常來源于高表達基因的UTR區域,如α-珠蛋白基因。PolyA尾不僅促進有效翻譯,還能增強mRNA的穩定性,可通過DNA模板編碼或在體外轉錄后添加。此外,質粒中還設計了特定的限制酶位點,便于質粒DNA的線性化,為后續的體外轉錄(IVT)做準備。


2

質粒DNA準備

質粒DNA的準備是mRNA合成的基礎。通過細菌轉化,使用STBL3大腸桿菌細胞放大編碼mRNA模板的質粒DNA。這一過程包括將少量質粒DNA與細菌細胞混合、熱激處理、培養以及篩選單個菌落進行擴增。最終,使用市售的無內毒素質粒DNA分離試劑(如Promega的PureYield Plasmid Maxiprep System)提取質粒DNA,以確保后續實驗的順利進行。


3

骨髓源性樹突狀細胞(BMDCs)的生成

樹突狀細胞(DCs)是專業的抗原呈遞細胞,在啟動免疫反應中發揮關鍵作用。本研究中,通過從6-8周齡小鼠的骨髓中分離細胞,并在GM-CSF的作用下培養分化成BMDCs。這一過程需要精確的細胞操作和培養條件控制,以確保獲得高質量的BMDCs,用于后續的體外實驗。


4

B16F10黑色素瘤細胞的收集

B16F10黑色素瘤細胞系用于模擬腫瘤環境,評估疫苗的抗腫瘤效果。細胞在DMEM培養基中培養,至少在解凍后3-7天收集,以確保細胞從解凍過程中恢復,保持良好的生長狀態。收集的細胞用于后續的體內移植實驗,以評估疫苗的保護效果。


5

mRNA合成與質量控制

mRNA的合成是疫苗制備的關鍵步驟。使用線性化的DNA模板進行體外轉錄(IVT),并在反應中加入CleanCap AG和N1-甲基偽尿苷-5'-三磷酸(m1c),以減少mRNA的免疫原性并提高翻譯效率。合成后的mRNA通過Agilent RNA 6000 Nano kit assay進行質量控制,確保mRNA的純度和完整性。此外,通過dot-blot分析檢測IVT RNA樣本中的雙鏈RNA(dsRNA)含量,因為dsRNA可能具有免疫原性,影響疫苗的安全性和有效性。


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圖 1 .mRNA 純度和免疫原性的表征


6

I型干擾素(IFN-I)反應檢測

為了評估mRNA的免疫原性,使用THP-1細胞系檢測IVT mRNA封裝在脂質體中的I型干擾素反應。這一檢測不僅有助于評估mRNA本身的免疫原性,還能反映LNP封裝對mRNA免疫原性的影響。通過量化細胞上清中的干擾素水平,可以篩選出免疫原性較低的mRNA構建體,為疫苗的安全性提供保障。


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mRNA-LNP的制備與表征

mRNA-LNP的制備是疫苗遞送系統的關鍵環節。將mRNA封裝在LNP中,以保護mRNA免受降解,并促進其通過內吞/吞噬途徑進入細胞。本期文章將繼續分享mRNA-LNP的制備流程,包括含、RNA的水相樣品準備和微流控法包封mRNA-LNP。


7.1 LNP脂質配制:


LNP的脂質組分是影響其性能的關鍵因素之一。常用的LNP配方包括可電離脂質、磷脂DSPC、膽固醇和穩定劑,其摩爾比為50:10:37.5:2.5。這種配方經過優化,能夠有效地保護mRNA,促進其在細胞內的釋放,并減少免疫原性。

在實際應用中,根據不同的mRNA疫苗或藥物的需求,脂質的摩爾比例和總濃度可能會有所調整。例如,BioNTech的BNT-162b2、Moderna的mRNA-1273以及Alnylam的Onpattro等獲批用于人體的LNP配方,其脂質組分和摩爾比例各有特點,以適應不同的治療目標和遞送需求。


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7.2 mRNA樣品準備:


mRNA樣品的濃度和氮磷比(N/P)是影響LNP包封效果的重要參數。N/P比是指脂質中的氮原子與mRNA中的磷原子的摩爾比,常用的N/P比為4、6或8。N/P比的計算公式為:

N/P=脂質含N摩爾數/mRNA含P摩爾數

磷(P):每個堿基含有一個磷酸根,1 mol的核糖核苷酸包含1 mol的磷酸基團。RNA脫水聚合后的平均分子量均值為320.5 g/mol。

氮(N):常規的四組分LNP脂質中,以可電離脂質比例計算氮原子數,每個可電離脂質包含1個氮原子(D-LIN-MC3、ALC-0315、SM-102)。以可電離脂質占比50%計算,每mol總脂質中包含0.5 mol的氮原子。注:部分脂質含有多個N原子,或多個組分含有N原子,計算時需注意。

在制備過程中,根據脂質摩爾濃度和N/P比,可以計算出所需的mRNA濃度。例如,當總脂質摩爾濃度為12mM,N/P比為6時,mRNA的濃度約為107 μg/mL。


7.3 微流控包封:


mRNA-LNP的包封具體步驟如下:

料液準備:按照實驗設計,配置水相(包含緩沖液和mRNA)和有機相(脂質混合物)。

注射器裝載:將水相和有機相分別吸入注射器中,并排出空氣。將裝有mRNA溶液的注射器和裝有脂質混合物的注射器插入芯片接口。

儀器設置:設置總流速(TFR)為12mL/min、總體積2mL、水相/有機相流速比(FRR)為3:1,初始排廢體積為0.35mL,結束排廢量為0.05 mL。

運行與收集:啟動儀器,收集包封后的mRNA-LNP樣品。

后處理:通過超濾或透析將mRNA-LNP換液至特定緩沖液,以去除有機溶劑。


7.4 理化數據檢測:


制備后的mRNA-LNP通過動態光散射(DLS)和Quant-it Ribogreen測定法進行物理化學特性表征,評估其粒徑、電位、封裝效率和穩定性。這些參數對于確保疫苗的有效遞送和釋放至關重要。


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圖 2 .新鮮和冷凍 mRNA-LNPs 的理化及穩定性特性的測定


8

抗原呈遞的評估

在B16F10癌細胞系和BMDCs中轉染mRNA疫苗后,使用抗H2-Kb/SIINFEKL-PE偶聯抗體檢測SIINFEKL肽在H2-Kb上的呈遞。這一實驗步驟不僅驗證了mRNA疫苗在細胞內的翻譯和抗原呈遞能力,還作為質量控制的關鍵環節,確保疫苗能夠有效激活免疫系統


9

小鼠免疫實驗與抗原特異性T細胞反應評估

在小鼠模型中,通過尾靜脈注射mRNA-LNP疫苗進行免疫,評估其誘導的抗原特異性CD8+ T細胞反應。使用四聚體肽-MHC-I復合物(tetramers)檢測抗原特異性T細胞,為疫苗的免疫原性提供直接證據。此外,通過腫瘤挑戰模型評估疫苗的抗腫瘤效果,以腫瘤生長作為指標,進一步驗證疫苗的實際應用潛力。


9.1 第 1 - 5 天:給小鼠進行免疫:


  1. 通過腹腔注射 0.1ml 20% Ketamine、10% Pentobarbital Sodium混合液(用蒸餾水稀釋)使小鼠麻醉(假設小鼠體重為 25 克,麻醉液的注射量應根據體重和麻醉反應進行調整)。
  2. 每只小鼠通過眼眶后注射 125μl 1 倍 PBS 稀釋的 10μg mRNA-LNP 進行免疫。作為陰性對照,用 1 倍 PBS 對小鼠進行免疫(圖 4A)。注意:mRNA-LNP 疫苗可通過其他途徑給藥,如肌肉注射、皮內注射、皮下注射或鼻內注射。不同的給藥途徑會對免疫反應的動態和特性產生不同的影響。
  3. 在第 5 天給予加強劑量,即 10μg mRNA-LNP 或 1 倍 PBS 作為陰性對照


9.2 第 8 天:分離外周血單個核細胞(PBMC)和脾細胞:


  1. 在 6 孔板中加入 5ml cold RPMI 培養基,并準備用于脾臟和血液采集的帶標簽微量離心管。
  2. 通過吸入致死劑量的二氧化碳,隨后進行頸椎脫臼的方式處死一只小鼠。立即開始解剖。
  3. 采血。
  4. 脾臟采集。
  5. 外周血單個核細胞(PBMC)分離。
  6. 脾細胞分離。
  7. 第 8 天及以后:使用冷凍的外周血單個核細胞(PBMC)和脾細胞進行多聚體染色分析:注意:在此步驟中,將準備好的 PBMC 和脾細胞用與 mRNA-LNP 疫苗編碼的抗原相對應的 MHC-肽多聚體進行染色。
    最后,每種待分析的組織類型都需要制備對照。
  8. 使用新鮮的外周血單個核細胞(PBMC)和脾細胞進行四聚體染色分析。
  9. 去除上清液,每孔用 50μl 四聚體染色緩沖液(含 2%胎牛血清的 PBS)和 50nM 達沙替尼重懸。在 25℃ 下孵育 30 分鐘。
  10. 將四聚體儲備液在四聚體染色緩沖液中 1:10 稀釋,每孔準備 5μl 稀釋后的四聚體溶液。
  11. 每孔加入 5μl 四聚體溶液(含 0.5μl 四聚體),重懸所有孔以混合。
  12. 在冰上避光孵育 30 分鐘。
  13. 向每個孔中加入 150μl 四聚體染色緩沖液,然后離心(500×g,5 分鐘,4℃)。
  14. 撒掉上清液,用 200μl 四聚體染色緩沖液重懸,再次離心(500×g,5 分鐘,4℃)。
  15. 撒掉上清液,用 100μl 表面染色混合液重懸每個孔。
  16. 在冰上避光孵育 25 分鐘。每孔準備 100μl 表面染色混合液,含1:1000 的死活染料、1:800 的抗 CD8 AF647 以及 1:400 的抗 CD45 PerCP-Cy5.5、抗 CD3 BV421 和抗 CD4 BV711,均在四聚體染色緩沖液中。
  17. 向每個孔中加入 100μl 四聚體染色緩沖液,離心(500×g,5 分鐘,4℃)。
  18. 撒去上清液。
  19. 用 200μl 四聚體染色緩沖液重懸每個孔,再次離心(500×g,5 分鐘,4℃)。
  20. 撒去上清液,用 200μl 四聚體染色緩沖液重懸。
  21. 將樣本置于 4℃ 避光保存,直至準備通過流式細胞術進行分析(圖 4A - 4E)。注意:最佳熒光素的選擇取決于所使用的流式細胞儀。


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圖 4. mRNA-LNP 疫苗接種后抗原特異性 T 細胞的誘導及抗腫瘤免疫反應


結論

本研究詳細介紹了mRNA脂質納米顆粒疫苗的開發流程和小鼠免疫效率分析的實驗方案。從mRNA序列設計到LNP封裝,再到小鼠免疫實驗,每一步都經過精心設計和嚴格的質量控制。通過這一方案,我們能夠開發出具有高效免疫原性和良好安全性的mRNA疫苗,為預防和治療疾病提供新的策略。盡管實驗過程中存在一些局限性,如僅測量IFN-I反應來評估mRNA免疫原性,以及依賴特定抗體來測量抗原呈遞,但通過不斷優化和改進,mRNA疫苗技術有望在未來的醫學領域發揮更大的作用。


參考文獻:[1] Karekar N, Reid Cahn A, Morla-Folch J, Saffon A, Ward RW, Ananthanarayanan A, Teunissen AJP, Bhardwaj N, Vabre. Protocol for the development of mRNA lipid nanoparticle vaccines and analysis of immunization efficiency in mice. STAR Protoc. 2024 Jun 21;5(2):103087. doi: 10.1016/j.xpro.2024.103087.



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