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細胞系STR鑒定資料

時間:2023/11/9閱讀:667
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一、什么是細胞系

初代培養物開始次傳代培養后的細胞,即稱之為細胞系。如細胞系的生存期有限,則稱之為有限細胞系(Finite Cell Line);已獲無限繁殖能力能持續生存的細胞系,稱連續細胞系或無限細胞系 ( I n f i n i t e C e l l L i n e ) 。

二、介紹

細胞系缺少系統命名的標準,導致了細胞系的錯誤鑒定,交叉污染以及缺乏注釋等問題。

三、細胞生物學研究狀況

細胞系作為正常或腫瘤組織的模式細胞被廣泛應用于科學研究和藥物開發,然而很大一部分的細胞系被錯誤標記或被其它個體、組織、種系來源的細胞所替代 。

在細胞生物學領域,文章一直在發表,科研成果一直在公布,但是當中哺乳動物細胞被錯誤鑒定,存在交叉污染的情況也同時存在著。

2010年《國際癌癥雜志》(IJC)統計出一列表,在346篇文章中,有 103篇存在細胞被

Hela細胞污染的情況。

建立的大鼠(rat)視網膜神經節的細胞系,命名為RGC-5。在隨后的十幾年時間里,至少230篇論文的研究與假設是建立在這株細胞系上。結果在2009年,序列測定結果表明,RGC-5是一株小鼠(mouse)細胞。

四、細胞系交叉污染

五、細胞交叉污染來源

1. 通過其他實驗室饋贈獲得細胞系

2. 細胞系的長時間連續培養

3. 使用滋養層細胞

4. 培養瓶的錯誤標記

5. 同時操作多種細胞系

6. 多種細胞系公共使用同一培養基

7. CO2培養箱


細胞錯誤鑒定的后果

1. 細胞系的損失

2. 時間和金錢的損失

3. 在公眾領域(文獻等)提供錯誤信息

4. 造成實驗結果不一致或不可重復

5. 個人:尷尬;公眾:羞辱


如何減少細胞系交叉污染

1. 從信譽良好的組織或機構獲得細胞系

2. 良好的文檔編制方法

3. 訓練有素的技術操作員

4. 每種細胞系單獨使用培養基

5. 溶液或試劑分裝使用

6.常規性地注意細胞系身份以及其特性是否發生污染

7.早期做好充足的凍存儲備

8.細胞培養代數不要太高



何時需做細胞系鑒定

1、發表文章或申請課題經費前;

2、使用細胞進行臨床治療(試驗)前;

3、準備凍存保種或已凍存多年的細胞;

4、一個涉及到細胞試驗項目開始/結束時;

5、新得到的細胞或實驗室培養5代以上的細胞;

6、細胞系表現不穩定或結果與預期差別較大;


已開始要求細胞系鑒定的期刊

Cell

Nature;

Bio Techniques;

Cancer Research;

Cancer Discovery;

Clinical Cancer Research;

Molecular Cancer Research;

Cancer Prevention Research;

International Journal of Cancer;

Molecular Cancer Therapeutics;

Cell Biochemistry and Biophysics;

Cancer Epidemiology, Biomarkers & Prevention;

In Vitro Cellular & Developmental Biology – Animal

六、細胞系的鑒定方法

1)鑒定細胞的種系來源:常用方法主要有染色體分析、同工酶分析(乳酸脫氫酶,嘌呤核苷磷酸化酶,葡萄糖-6-磷酸脫氫酶,蘋果酸脫氫酶等)、DNA指紋圖譜等技術。

2)鑒定細胞的組織來源:可通過形態學手段(上皮細胞樣 ,成纖維細胞樣 ,淋巴母細胞樣等 )、檢測組織特異性抗原等進行鑒定。

3)細胞是否發生轉化和惡變:主要通過核型分析、細胞生長行為觀 察(是否喪失接觸抑制)等進行鑒定。

4)細胞有無發生交叉污染:主要通過同工酶及DNA指紋圖譜技術進行鑒定。

七、不同細胞鑒定技術比較細胞系鑒定與STR

STR(Short TandemRepeat,短串聯重復序列)基因分型已被ICLAC、ATCC等機構作為金標準應用于細胞鑒定 。

細胞STR數據庫

美國的ATCC 細胞庫

德國的DSMZ細胞庫

日本的RIKEN細胞庫

日本的JCRB細胞庫

STR位點數分辨率比較

細胞系鑒定服務

為了進一步提高鑒定的分辨率,除了包含ATCC檢測的8個STR和1個性別決定位點Amelogenin外,另新增了11個高度多態性位點 ,共檢測20個STR位點。


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