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將裝有樣品的濾紙包用長鑷子放入抽提筒中，注入一次虹吸量的1.67 倍的石油醚，使樣品包浸沒在石油醚中。連接好抽提器各部分，接通冷凝水水流，在恒溫水浴中進行抽提，調節水溫在70~80℃之間，使冷凝下滴的成連珠狀（120~150 滴/min 或回流7 次/h 以上），抽提至抽取筒內的用濾紙點滴檢查無油跡為止（約需6~12h）。抽提完畢后，用長鑷子取出濾紙包，在通風處使揮發（抽提室溫以12~25℃為宜）。提取瓶中的另行回收。
　　索氏提取法其他方面的注意事項：
　　（1）索氏抽提法測定脂肪最大的不足是耗時過長，如能將樣品先回流1~2 次，然后浸泡在溶劑中過夜，次日再繼續抽提，則可明顯縮短抽提時間。
　　（2）若實驗中樣品較多的話，可采用容量更大的YG -Ⅱ型油分測定器來測定脂肪含量，溫度控制在70℃左右，8h 可提取完畢。