目錄:上海烜雅生物科技有限公司>>分子生物學試劑>>試劑盒>> DNA 甲基化修飾試劑盒(凝膠法)
供貨周期 | 現貨 | 規格 | 150次 |
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貨號 | XY-D-1629 | 應用領域 | 化工,生物產業 |
主要用途 | 科研 | 英文名稱 | / |
保存條件 | -20℃ | 有效期 | 12個月 |
產品簡介:
DNA 甲基化分析中的關鍵步驟是亞硫酸氫鹽修飾 DNA,此反應要求 DNA 必須處于單鏈狀態,反應還必須在低溫進行。由于常規的修飾反應都在液相進行,在低溫下讓液相中的 DNA 保持單鏈狀態非常棘手,故修飾效率很低。此外,修飾反應要多次切換反應液, 有多個沉淀步驟,故 DNA 回收率一般都不高于 50%。為克服這些缺點,本公司開發出了此產品。
產品特點:
1.用包埋的 DNA 進行所有操作,免去所有沉淀和純化步驟,極大簡化了操作。
2.免去了 DNA 提取過程,所需實驗材料更少,最少幾個細胞都可以,極大地節約了寶貴材料,尤其適用于珍-稀材料。
3.包埋中的 DNA 在整個操作過程中都處于單鏈狀態,提高了修飾效率。
4.DNA 包埋在包埋塊中,切換反應液不但非常方便,而且 DNA 回收率都在 90%以上。
5.既適用于實體材料和懸浮細胞,也適用于純化好的 DNA 樣品。
6.DNA 甲基化修飾試劑盒(凝膠法)足夠制備 150 多個 10uL 包埋塊(如果用純化好的 DNA)或 25 個 10uL 包埋塊(如果用懸浮細胞)。
產品參數:
產品規格
成分 | 規格 | 包裝 |
DNA 甲基化修飾溶液 A | 30 mL | 30 mL 本色瓶 |
包埋液 | 1.5 mL | 2.0 mL 藍蓋、低溫成分 |
包埋塊裂解液 | 12.5 mL | 15 mL 低溫成分 |
分子生物學級石蠟油 | 25 mL | 30 mL 本色瓶 |
蛋白酶 K 溶液(10mg/mL) | 150 uL | 2.0 mL 紅蓋,低溫成分 |
DNA 甲基化修飾溶液B 成分一 | 2.3 g×5 | 5mL 本色瓶 |
DNA 甲基化修飾溶液B 成分二 | 110 mg×5 | 1.5mL 棕色離心管 |
TE 緩沖液,pH 8.0 | 125 mL | 125 mL 本色瓶 |
使用手冊 | 1 份 | 無 |
保存和運輸
常溫運輸及保存。蛋白酶 K 溶液(10mg/mL)、包埋液、包埋塊裂解液需低溫運輸,
-20℃保存。有效期一年。
自備試劑
超純水
使用方法:
一、準備試劑
1.在裝有 2.3g 天凈沙甲基化修飾溶液B 成分一干粉的棕色瓶中加入 3.9 mL 水和 0.9 mL 天凈沙甲基化修飾溶液 A,搖晃溶解得到 4.8 mL 溶液 B 成分一。
2.在裝有 110mg 溶液 B 成分二干粉的離心管中加入 1 mL 50℃預熱的超純水,搖晃溶解,得到溶液 B 成分二。
3.將 0.6 mL 溶液 B 成分二加入到 4.8 mL 溶液 B 成分一中,得到 5.4 mL 溶液 B 工作液,冰上放置待用。未用完的溶液 B 工作液不得再使用。
4.每次實驗前,將裝有 1.5 mL 包埋液的離心管在沸水浴上放置數分鐘直到變成溶液, 然后放 80℃待用。
二、對微量組織材料(如果材料足夠,可先純化 DNA,再直接進入第三步)
5.用常規的胰-酶消化法處理動物實體組織或培養細胞,得到濃度不超過 60 個細胞/uL 的單細胞 PBS 懸液。如果實驗材料已經是單細胞懸浮液(如卵細胞),則 PBS 洗滌后直接離心沉淀,再重懸在 PBS 中(濃度不超過 60 個細胞/uL)。注:本試劑盒不含本步所需相關試劑,如胰-酶消化液和 PBS。
6.在一個自備的 2 mL 離心管中加入 3 uL 上步所得細胞懸液,再迅速滴加 7 uL 在80℃預熱的包埋液,共得 10uL 包埋液-細胞混合液。注:不需要吹打混勻以免混合液在搶頭里面凝固。
7.加入 500 uL 分子生物學級石蠟油確保后續處理過程中溶液不會蒸發。短暫離心確保10uL 包埋液-細胞混合液沉到管底。
8.將離心管在沸冰浴中放 20 分,此步可將 DNA 分子變性成單鏈。
9.將離心管轉移到冰上放置 30 分鐘,包埋液-細胞混合液將凝固成 10uL 的包埋塊, 包埋塊中將包含細胞的基因組 DNA 和蛋白質組份。
10.在包埋塊中加入 500 uL 包埋塊裂解液和 5 uL 蛋白酶 K 溶液(10mg/mL),短暫離心后 37℃保溫過夜。此步將降解包埋塊中的蛋白質組份。
11.吸棄包埋塊之外的所有溶液(包括石蠟油)后,分別用 1mL TE 緩沖液室溫浸泡包埋塊 2 次,每次 15 分鐘。此步可去除殘留在包埋塊中的裂解液和蛋白酶 K。
12.酶切包埋塊中的基因組 DNA:選定不識別 PCR 靶片段的內切酶(本試劑不提供該試劑),再用此酶對應的 100 uL 1×酶切緩沖室溫液浸泡包埋塊 15 分鐘,吸棄該緩沖液后再加入 100 uL1×酶切緩沖和 50U 選的的內切酶,37℃保溫 2 小時后吸棄內切酶反應液。
13.加入 500uL 新鮮配制的處理液 A,室溫放置 15 分鐘后吸棄處理液 A。處理液 A 配制方法:100 uL DNA 甲基化修飾溶液 A +400 uL 超純水。
14.重復上步一次。此時 DNA 將呈單鏈。
15.加入 1 mL 新鮮配制的處理液 B(不是溶液 B),室溫浸泡包埋塊 5 分鐘后吸棄處理液 B。處理液 B 配制方法:50uL DNA 甲基化修飾溶液 A +950 uL 超純水。
16.加入 750uL 石蠟油,然后沸水浴 30 秒,使 DNA 變性。
17.將離心管轉移到冰上放置 30 分鐘使包埋塊重新凝固,單鏈 DNA 將固化。
18.在離心管中加入 1mL 在第 3 步預冷的溶液 B 工作液,短暫離心后繼續在冰上放置30 分鐘。此步用于修飾固化的單鏈 DNA。
19.將離心管轉移到 50℃放置 3.5 小時后吸棄溶液 B 工作液。
20.分別用 1mL TE 緩沖液常溫洗滌包埋塊 2 次,每次 15 分鐘,吸棄 TE 緩沖液。
21.分別用 500 uL 新鮮配制的處理液 C(50 uL DNA 甲基化修飾溶液 A +450 uL 超純水)常溫洗滌包埋塊 2 次,每次 15 分鐘,然后吸棄處理液 C。
22.用 1 mL TE 緩沖液常溫洗滌包埋塊 3 次,每次 10 分鐘,然后吸棄 TE 緩沖液。
23.所得包埋塊可以在 4℃保存數月待用,也可以用超純水洗滌兩次(每次 15 分鐘)后直接用做 100uL 體系甲基化 PCR 的模板。
三、對純化好的DNA 溶液
24.如果樣本是純化好的 DNA 溶液,先用不識別 PCR 靶片段的合適內切酶酶切 DNA, 總體積不超過 20uL,DNA 不超過 700 ng。本試劑盒不提供所需內切酶。
25.酶切結束后,沸水浴 10 分鐘滅活內切酶并變性 DNA。
26.冰上放置并短暫離心數秒后,再加入 4 uL DNA 甲基化修飾溶液 A,50℃保溫 15 分鐘。
27.迅速加入 50 uL 在 80℃預熱的包埋液,用手指快速彈擊管底混勻溶液并繼續放 80℃ 待用。不要吹打混勻以避免包埋液在移液槍頭中凝固。
28.在一個新的 2 mL 離心管中,加入1 mL 第 3 步預冷的溶液B 工作液,再加上 750 uL 石蠟油,短暫離心后將離心管放冰上預冷。
29.迅速取 80℃保溫的混合液 10uL(第 27 步),用在空中滴加的方式加到第 28 步準備的預冷離心管中,滴加的混合液遇冷將迅速在石蠟油中形成一個包埋塊。注意: 不要將槍頭浸入到預冷的溶液中,否則包埋液將迅速在槍頭內凝固。如果包埋塊沒 有沉到管底,可以用槍頭將其撥到石蠟層下面的液相中。
30.再重復上步操作 6 次,共可以得到 7 個包埋塊(每塊約含 100ng DNA)。
31.將離心管(含 7 個包埋塊)繼續放冰上 30 分鐘進行修飾。
32.后續操作同第 19-23 步。
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