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PerkinElmer唾液樣品優化方案之利器—珠磨均質器

來源:北京平利洋醫療設備有限公司   2021年07月21日 16:15  

實驗案例



日前來自美國佐治亞州奧古斯塔大學Augusta University的多位科學家利用PerkinElmer的SAR-CoV-2檢測方案對來多個自醫療機構和社區收集到的429份對應的鼻咽拭子和唾液樣品進行檢測,以分析唾液樣品、鼻咽拭子的檢測效果,以及利用唾液樣品檢測優化方案后的檢測效果。


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樣本處理和SARAS-CoV-2分析工作流程示意圖概述:對在醫療機構和社中采集的對應鼻咽拭子和唾液樣本進行測試和驗證。1、U方案:使用U方案對鼻炎拭子或唾液樣本進行SARS-CoV-2檢測流程(唾液樣品不經過均質,直接用于RNA提取);2、SalivaAll方案:使用SalivaAll方案對唾液樣本進行核酸檢測流程(在唾液樣品提取RNA之前利用珠磨機均質器進行唾液均質化步驟);3、SalivaAll混樣方案:唾液樣本均質后按5:1進行混樣,然后進行RNA提取、RT-PCR檢測。


實驗流程及結果如下


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U方案通過RT-PCR檢測240個對應的鼻咽拭子和唾液樣本的SARS-CoV-2。結果顯示 28.3%(68/240)的樣本從唾液、鼻咽拭子或兩者中檢測出SARS-CoV-2陽性。唾液中的檢出率50.0%(34/68)低于鼻咽拭子的檢出率89.7%(61/68)。


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SalivaAll方案對189個對應的鼻咽拭子和唾液樣本進行了檢測,在提取RNA之前利用BeadBoost珠磨均質器對唾液樣品進行樣本均質化步驟,然后進行核酸提取、RT-PCR。結果顯示,50.2%(95/189)的樣本從唾液、鼻咽拭子或兩者中檢測出SARS-CoV-2陽性。唾液中SARS-CoV-2的檢出率97.8%(93/95)高于鼻咽拭子檢出率78.9%(75/95)。


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U方案與SalivaAll方案比較:對U方案檢測的85份唾液樣本用SalivaAll方案再次進行檢測,對兩種方案進行評估。在兩種方案評估的85份唾液樣本中,57.6%(49份)的SARS-CoV-2檢測呈陽性,在U方案、SalivaAll方案或兩者皆有。唾液樣品SalivaAll方案的檢出率為100%(49/49),而U方案的檢出率為36.7%(18/49)。


SalivaAll混樣方案根據FDA5:1的混樣建議,分別利用1個陽性樣品和4個陰性樣品混成陽性混樣,利用5個陰性樣品混成陰性混樣。陽性混樣和陰性混樣各混20個樣品。利用SalivaAll混樣方案,唾液樣本均質后每個樣品取60ul進行混樣,5個樣品總體積為300ul混樣,然后進行RNA提取、RT-PCR檢測。結果顯示,20個陽性混樣的檢測準確性為95%,陰性混樣的檢測準確性為100%。


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研究表明傳統的SARS-CoV-2核酸檢測流程在唾液樣本的操作和檢測靈敏度等方面具有一定的挑戰。通過PerkinElmer優化的唾液樣品檢測方案,在RNA提取之前加上唾液樣品均質處理步驟,檢測結果靈敏性大幅提升,檢測靈敏度高于鼻咽拭子,同時可以對唾液樣品進行混樣檢測。


此款珠磨均質器先進技術來自OMNI International公司,PerkinElmer已于 2021年1月正式收購OMNI International,這是一家專業的樣品均質技術公司。OMNI的珠磨均質技術是PerkinElmer新推出并獲CE認證的SARS-CoV-2唾液檢測流程的一個關鍵組成部分。進一步完善了PerkinElmer基因組學全流程解決方案。PerkinElmer致力于為客戶提供滿足其科研和臨床測試需求的完整解決方案。


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