根腐病又稱“植物癌癥”，該病發(fā)生范圍廣、極易傳染，是毀滅性的土傳病害之一。該病具有隱蔽性，當?shù)厣喜勘憩F(xiàn)出明顯癥狀時，地下根系早已死亡過半。因此，培育抗病品種是防治該病的關(guān)鍵策略之一，而早期檢測及客觀評估疾病嚴重性是抗病品種培育中的一項重要步驟。

根系研究的關(guān)鍵在于對植物“隱藏的一半”進行可視化和量化，基于高光譜成像的根箱栽培法在抗性篩選及遺傳育種等領域具有廣泛的應用和出色的表現(xiàn)，北京易科泰生態(tài)技術(shù)公司推出了RhizoTron^®植物根系高光譜成像系統(tǒng)，為根腐病評估提供非接觸、非損傷、數(shù)字化、可視化解決方案。 

小麥根腐病識別

Gernot et.al基于根箱培養(yǎng)技術(shù)對小麥進行培養(yǎng)，并對植株進行扦插處理，基于根系高光譜成像技術(shù)，在扦插后第14、28、47、94、101和201天分別對根箱的上三分之一進行高光譜成像（900-1700nm）。基于一階導數(shù)差分光譜（1649-1447nm）構(gòu)建根系腐爛時間指數(shù)模型，使用修剪后28天和101天的光譜數(shù)據(jù)作為驗證集，其R²=0.96。

不同基因型扁豆的霉菌根腐病評估

Afef et.al以不同基因型扁豆為實驗對象，設置對照組和實驗組，培養(yǎng)14日后實驗組接種黃芽孢桿菌，對照組施以清水。接種14日后使用0-5疾病評分量表對根系進行評分，作為地面參考數(shù)據(jù)^[11]。采用高光譜成像技術(shù)對植株地上和地下部分進行成像分析，通過研究高通量表型技術(shù)評估霉菌根腐病的嚴重程度，以快速鑒別耐藥基因型。

通過提取感興趣區(qū)的光譜，發(fā)現(xiàn)從地上樣品的高光譜反射曲線來看，健康和感染的樣品光譜反射曲線相差較小，而根系的光譜曲線差異較顯著。使用歸一化差異光譜指數(shù)（NDSI）對根系疾病程度進行預測，其R²達到0.54，使用地上部光譜特征進行預測，其R²僅為0.27。結(jié)果表明，相比較于地上部，根系高光譜成像技術(shù)能夠更好的評估根腐病。

參考文獻

[1] Gernot B , Mouhannad A , Alireza N , et al. RGB and Spectral Root Imaging for Plant Phenotyping and Physiological Research: Experimental Setupand Imaging Protocols. [J]. Journal of visualized experiments : JoVE, 2017, (126).

[2] Advanced Imaging for Quantitative Evaluation of Aphanomyces Root Rot Resistance in Lentil[J]. Frontiers in Plant Science,2019,10.