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離子色譜儀的重復性差可能由多種因素導致，以下是一些常見的原因：
儀器系統問題
- 泵系統故障：單向閥污染或產生氣泡、氮氣未開導致泵流速變小、漏液等，都會使流動相流速不穩定，進而影響保留時間的重復性。例如，單向閥內有氣泡時，氣泡的壓縮比大，可吸收和緩沖壓力，使小球與斜面接觸不緊密，液體回流，流速下降，保留時間延長且隨機變化。
- 檢測器問題：檢測器故障信號不穩定、抑制器電流不穩定等，會導致基線噪聲增大，影響低濃度樣品的重復性。比如抑制器效果下降，會使背景電導增高，噪聲加大，從而影響檢測結果。
- 進樣系統故障：手動進樣時，注射器污染、一次性針頭過濾器未及時更換、取樣量不足等都會造成進樣量不準確，導致峰高或峰面積重復性差。自動進樣器若存在洗針不充分、洗針水長時間未更換、取樣量不足、設置不合理、樣品瓶離子析出或反應等問題，同樣會影響重復性。
樣品相關問題
- 樣品性質變化：樣品濃度極小時易吸收空氣中的離子，導致樣品濃度發生變化，影響檢測結果的重復性。此外，有機酸樣品易分解，樣品與容器材料發生反應、樣品容器中有離子溶出等情況，也會使樣品組成改變，造成重復性差。
- 樣品溫度和 pH 值影響：樣品溫度變化會導致重復性差，如剛從冰箱取出的標準溶液，其溫度與室溫相差較大，會影響離子的遷移速度和分離效果。pH 值影響峰形，不同的 pH 值條件下，樣品中離子的存在形式和電荷狀態不同，從而導致保留時間和峰面積的變化。
環境因素
- 溫度變化：柱溫變化會引起保留時間變化，電導池溫度變化則會導致峰高或峰面積變化，進而影響離子色譜儀的重復性。例如，溫度升高，離子的擴散速度加快，在固定相和流動相之間的分配系數改變，使得保留時間縮短。
- 濕度影響：環境濕度過高或過低，可能會導致儀器部件受潮或過于干燥，影響電子元件的性能和穩定性，從而對儀器的重復性產生間接影響。
操作與維護問題
- 操作不規范：操作人員的技術熟練程度和操作方法不一致，如進樣的深度、速度、角度等不同，會導致進樣量的重復性差。此外，未按照儀器操作規程進行操作，如開機預熱時間不足、參數設置不正確等，也會影響儀器的重復性。
- 維護保養不及時：儀器長期使用后，若未及時進行清潔、維護和保養，如色譜柱老化、抑制器維護不及時、管路堵塞等，會導致儀器性能下降，重復性變差。
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