轉錄因子是一類參與基因轉錄調控的重要調節因子。不同轉錄因子的DNA 結合結構域識別不同基因啟動子區特定的堿基序列,行使抑制或激活該基因轉錄的功能。將目的基因啟動子區域(通常取轉錄起始位點TSS 上游-2000bp)、或針對結合位點進行突變、或分段截斷序列,構建到報告基因載體luciferase 的上游,共轉染轉錄因子過表達質粒,通過熒光素酶活反映轉錄因子對啟動子活性的調控作用。
圖1.轉錄因子與啟動子調控示意圖
常用載體:pGL3-Basic 、pGL3-Promoter
圖2 .載體信息
翌圣雙熒光素酶報告基因檢測服務流程
客戶提供 | 翌圣服務 | 客戶所得 |
1、待研究啟動子基因詳細信息 2、轉錄因子詳細信息 | 1、轉錄因子和啟動子結合位點預測 2、方案設計、引物設計與合成 3、序列合成、質粒構建及細胞轉染 4、熒光素酶活性檢測 | 1、項目所得質粒及菌液 2、中間樣品 3、完整項目報告 |
實驗步驟
目的細胞質粒瞬轉預實驗
當選擇在目的細胞(而非293 工具細胞)中進行驗證實驗時,首先要確認目的細胞的質粒瞬轉效率,以及摸索合適的瞬轉體系,質粒瞬轉效率>40%以上時表明預實驗通過。
目的細胞質粒瞬轉預實驗
a. 將狀態良好,處于對數生長期的空白細胞用0.25%胰酶消化,用wanquan培養基懸浮成
單細胞懸液,細胞計數后,接種于24 孔培養板中;
b. 培養過夜,觀察細胞生長狀態。在細胞覆蓋率70%左右時,進行轉染實驗;
c. 轉染2 h 前換液為新鮮的培養基;
d. 轉染取無菌的1.5 mL EP 管,按照轉染試劑使用說明進行轉染復合物配置
e. 轉染48 h 后收集細胞樣品。
報告基因檢測
細胞樣品收集
a. 轉染后從培養箱中取靶細胞,輕輕吸凈培養液,PBS 洗滌2 次;
b. 棄去PBS,每孔加入100μL 的1×PLB(5X Passive Lysis Buffer 用無菌水稀釋而得);
c. 細胞裂解后,將樣品轉移入Ep 管中,-80 度冰箱保存。
根據報告基因檢測試劑盒說明書操作進行檢測
a. 將充分裂解后的裂解產物,10,000-15,000 rpm 離心3-5 min。離心后將上清液移入新的EP 管進行后續檢測。
b. Renilla Luciferase Assay 工作液的配置:按照樣品要求的量,將Renilla Luciferase Assay Reagent(100×)按照稀釋比例加入Renilla Luciferase Assay buffer,混勻后室溫放置。
c. 熒光素酶檢測:
按照儀器說明書要求將熒光檢測打開,設定參數,測定時間為10 s,測定間隔為2 s;將樣品按照20 μL 的體積加入測量管中(保持每次樣品的加樣量一致),另外加入20 μL Firefly Luciferase Assay Reagent 混勻2-3 次(不能漩渦混勻),充分混勻后測定RLU(Relative light unit),同時設置Cell Lysis buffer 為空白對照孔;將檢測后的樣品,加入20 μL 配制的Renilla Luciferase Assay 工作液混勻2-3 次,充分混勻后測定RLU,同時設置Renilla Luciferase Assay 工作液為空白對照孔。
數據處理與分析,計算相對熒光強度
提供原始實驗數據與完整實驗報告
常規檢測分組
(1)過表達對照+啟動子對照+海腎內參(TK)
(2)過表達對照+啟動子野生型+海腎內參(TK)
(3)過表達對照+啟動子突變型+海腎內參(TK)
(4)轉錄因子過表達+啟動子對照+海腎內參(TK)
(5)轉錄因子過表達+啟動子野生型+海腎內參(TK)
(6)轉錄因子過表達+啟動子突變型+海腎內參(TK)
實驗預期結果
轉錄因子促進靶基因啟動子區轉錄活性
轉錄因子抑制靶基因啟動子區轉錄活性
翌圣可提供雙熒光素酶報告基因檢測服務,加快基礎研究及藥物篩選進度
服務類型 | 客戶提供 | 服務內容 | 周期 |
雙熒光素酶驗證miRNA 與靶基因3’UTR 相互作用 | 1、miRNA基因及物種(具體的ID信息) 2、靶基因基因及物種 3. 結合位點信息 | 1、miRNA與3’UTR結合位點預測 2、方案設計、引物設計合成 3、miRNA mimics合成、質粒構建 4、細胞轉染及報告基因檢測
| 25-30個工作日 |
雙熒光素酶驗證lncRNA 與miRNA 相互作用 | 1、lcnRNA基因及物種 2、miRNA基因及物種(具體的ID信息) 3、結合位點信息 | 1、lncRNA 與miRNA結合位點預測 2、方案設計、引物設計合成 3、miRNA mimics合成、質粒構建 4、細胞轉染及報告基因檢測 | 25-30個工作日 |
雙熒光素酶驗證轉錄因子與啟動子區調控作用 | 1、啟動子信息(名稱、物種、序列) 2、啟動子基因模板(或委托我司合成/克隆) 3、 實驗用細胞(若選用293T細胞無需提供) | 1、轉錄因子與啟動子結合位點預測 2、方案設計、引物設計合成 3、序列合成、質粒構建 4、細胞轉染及報告基因檢測 | 30-35個工作日 |
信號通路分析 | 通路下游的響應元件序列 | 1、方案設計、引物設計合成 2、序列合成、質粒構建 | 30-35個工作日 |
SNP 活性分析 | 基因的啟動子區域存在單核苷酸多態性(SNP)信息 | 1、方案設計、引物設計合成 2、序列合成、質粒構建 | 30-35個工作日 |
相關產品清單
產品類別 | 產品名稱 | 產品貨號 | 產品規格 |
雙熒光素酶報告基因檢測試劑 | Dual Luciferase Reporter Gene Assay Kit 雙螢光素酶報告基因檢測試劑盒 | 11402ES60/80 | 100T/1000T |
Dual Glo Luciferase Reporter Gene Assay Kit 輝光型雙熒光素酶報告基因檢測試劑盒 | 11405ES60/80 | 100T/1000T | |
轉染試劑 | Hieff Trans® Liposomal Transfection Reagent 轉染試劑 | 40802ES01/03 | 100μL/1mL |
Hieff Trans® in vitro siRNA/miRNA Transfection Reagent轉染試劑 | 40806ES01/02/03 | 0.1mL/0.5mL /1mL | |
Hieff Trans® mRNA Transfection Reagent 轉染試劑 | 40809ES01/03 | 0.1mL/1mL |
相關產品
免責聲明
- 凡本網注明“來源:化工儀器網”的所有作品,均為浙江興旺寶明通網絡有限公司-化工儀器網合法擁有版權或有權使用的作品,未經本網授權不得轉載、摘編或利用其它方式使用上述作品。已經本網授權使用作品的,應在授權范圍內使用,并注明“來源:化工儀器網”。違反上述聲明者,本網將追究其相關法律責任。
- 本網轉載并注明自其他來源(非化工儀器網)的作品,目的在于傳遞更多信息,并不代表本網贊同其觀點和對其真實性負責,不承擔此類作品侵權行為的直接責任及連帶責任。其他媒體、網站或個人從本網轉載時,必須保留本網注明的作品第一來源,并自負版權等法律責任。
- 如涉及作品內容、版權等問題,請在作品發表之日起一周內與本網聯系,否則視為放棄相關權利。