操作賽默飛熒光定量PCR儀需要按照一系列步驟來配置設備、設置實驗程序、運行實驗和分析數據。以下是詳細的操作步驟和注意事項,幫助您順利完成實驗。
一、準備工作
在正式操作賽默飛熒光定量PCR儀前,請確保以下準備工作已完成:
檢查儀器狀態:
檢查反應體系:
確保計算機和儀器連接正常:
二、創建實驗程序
打開儀器:
進入實驗設置界面:
輸入實驗信息:
設置反應體系:
反應體積:根據實驗需求設置反應體積(常見體積有20 μL、25 μL、50 μL等)。
樣品信息:輸入樣品類型和濃度信息。確保樣品濃度與反應體系相匹配。
引物/探針選擇:輸入或選擇所使用的引物和探針信息。確保熒光探針的選擇正確,并且與所用的熒光染料兼容。
三、設置熱循環條件
設置溫度和時間:
變性溫度:通常設置在94-98°C之間。
退火溫度:根據引物的Tm值,通常設置在50-65°C之間。
擴增溫度:一般設置為72°C(適用于大多數DNA聚合酶)。
延伸時間:根據PCR產物的長度設定,通常設置為每千堿基15秒。
設置循環次數:
熔解曲線分析(可選):
四、選擇熒光檢測通道
選擇適當的熒光染料:
設置熒光信號采集時間點:
五、啟動實驗
檢查所有設置:
儀器運行:
六、數據分析
實驗完成后查看數據:
數據分析選項:
Ct值分析:根據熒光信號的變化,自動計算各樣本的Ct值,并進行基因定量。
標準曲線分析:如果需要定量分析樣本的濃度,可以通過標準曲線法進行分析。
熔解曲線分析:對PCR產物進行熔解曲線分析,檢查擴增產物的特異性。
導出數據:
七、實驗結束后的注意事項
清潔儀器:
保存實驗數據:
檢查儀器運行狀態:
八、常見問題及解決方法
信號過低或過高:
非特異性擴增:
實驗反應失敗:
總結
操作賽默飛熒光定量PCR儀需要按步驟配置實驗程序、設置反應體系、選擇合適的熱循環條件和熒光探針通道。儀器的智能化設計使得操作相對簡便,但仍然需要細致地檢查設置和反應體系,確保實驗的順利進行。通過合理設置和分析,您可以得到高質量的定量PCR結果。