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表觀轉錄因子 PCIF1 調控 CD8+ T 細胞鐵死亡與激活

來源:上海達為科生物科技有限公司   2025年04月01日 18:26  

《The epitranscriptional factor PCIF1 orchestrates CD8+ T cell ferroptosis and activation to control 

antitumor immunity》是 2025 年發表在《Nature Immunology》上的一篇文章, PCIF1是一種表觀轉錄因子,

通過調控RNA的m6Am修飾,在CD8+T細胞的抗腫瘤免疫反應中發揮關鍵作用。研究發現,PCIF1在CD8+T細胞

中具有抑制性作用,其缺失能夠增強T細胞的抗腫瘤活性,從而提高免疫治療的效果。


一、         研究背景

近年來,T細胞免疫療法作為一種新興的細胞免疫療法,在癌癥治療領域取得了顯著的突破,為患者帶來了

新的希望。然而,目前的治療效果在持久性方面仍存在一定的局限性,需要深入探究其內在分子機制以進一

步優化治療方案。研究發現,通過靶向關鍵的轉錄或表觀轉錄因子,可以顯著增強T細胞的抗腫瘤功能,從而

提升免疫治療的整體效果。

表觀轉錄組學作為當前生物學領域的一個新興分支,主要聚焦于RNA修飾及其在基因表達調控中的重要作用。

其中,m6AmN6,2'-O-二甲基腺苷)作為一種重要的RNA修飾,是真核生物mRNA帽端的修飾之一。在生物學

過程中,m6Am修飾在基因表達調控中扮演著關鍵角色,它可以影響mRNA的穩定性、翻譯效率以及剪接等過

程,從而精細地調控基因表達。

在該篇文章中,研究人員發現m6Am修飾通過 PCIF1 這一甲基轉移酶來實現,PCIF1 催化 m6Am沉積在 mRNA 

 5' 端,從而調控基因表達。研究發現,Pcif1 缺失會導致 m6Am 修飾的靶基因(如鐵死亡抑制基因 

Fth1Slc3a2  T 細胞激活基因 Cd69)表達增加,進而賦予 CD8+ T細胞對鐵死亡的抗性和增強其激活能力,

最終增強抗腫瘤免疫反應。

二、         研究結果

1)       提高 Pcif1 基因缺失小鼠的腫瘤免疫力

為探究PCIF1在體內調控抗腫瘤免疫的生理作用,研究人員構建了全身性Pcif1敲除小鼠(Pcif1 KO),通過將

Pcif1fl/fl小鼠與CAG-Cre轉基因小鼠雜交,刪除Pcif1基因15個編碼外顯子中的10個(外顯子5-14),在C57BL/6

背景下生成Pcif1 KO小鼠。分子檢測證實其脾臟、肺、心臟和肝臟中Pcif1蛋白wan全缺失,且該敲除小鼠在8周齡

時體重、肝功能、血常規及T細胞亞群組成與野生型(WT)小鼠均無顯著差異,表現出正常生存能力和繁殖能

力。進一步通過LLCB16-F10MC38同基因腫瘤模型發現,Pcif1 KO小鼠的腫瘤生長速度顯著減緩,生存期顯

著延長,表明Pcif1缺失可抑制多種腫瘤模型的生長并延長宿主存活時間。

image.png 

2)       Pcif1 KO 可通過 CD8+ Teff細胞提高抗腫瘤免疫力

為探究PCIF1在抗腫瘤免疫中的作用,研究人員構建了全身性Pcif1 KOT細胞特異性敲除小鼠(Pcif1 cKO)。

通過scRNA-seq和流式細胞術分析發現,Pcif1缺失顯著增加TMECD8+ T細胞比例及效應細胞因子IFNγ

TNFGzmb分泌,并促進PD-1+Tcf-1+干性、CD44+CD8+記憶性T細胞亞群、CD69+CD103+CD8+組織駐留記憶

T細胞的富集,同時減少耗竭型PD-1+Tim3+CD8+T細胞。選擇性耗竭實驗證實,CD8+T細胞是Pcif1 KO小鼠腫瘤生

長抑制的關鍵因素。T細胞特異性敲除模型進一步驗證,Pcif1缺失通過增強T細胞抗腫瘤免疫應答,顯著抑制LLC

腫瘤和B16-F10黑色素瘤的生長并延長生存期。這些發現為以下觀點提供了證據:TME 中腫瘤浸潤 CD8+Teff

細胞的增加有助于增強 Pcif1 cKO 小鼠的抗腫瘤免疫反應。

image.png 

3)       PCIF1 通過 m6Am修飾調節 CD8+細胞活化

研究發現,Pcif1 缺失通過增強 TCR信號通路活性顯著提升 CD8+細胞的體外激活水平及細胞毒性功能,

Pcif1 KO小鼠 CD8+細胞在抗CD3/CD28 抗體刺激后,活化標志物 CD69 的表達量及效應因子 IFNγTNF

Gzmb 的分泌水平均顯著高于WT細胞,且 TCR 通路關鍵分子 LCK  LAT 的磷酸化水平顯著增強。進一步

機制研究表明,Pcif1  m?Am甲基轉移酶活性是其抑制 CD8+細胞激活的關鍵,催化失活突變體(Asn552Ala

無法逆轉 Pcif1 敲除導致的 CD8+ T細胞過度活化,而野生型 Pcif1 的異位表達可有效恢復細胞因子分泌及 mRNA

 表達水平,這些結果表明,PCIF1 主要通過其 m6Am甲基轉移酶活性抑制 CD8+細胞的活化。


image.png

 

4)       鑒定 CD8+細胞中的 Pcif1 下游靶標

研究揭示了PCIF1通過其m?Am甲基轉移酶活性調控CD8+T細胞激活與鐵死亡的機制。代謝標記與

TMT-MS分析顯示,Pcif1敲除CD8+T細胞整體蛋白翻譯未顯著變化,但有312個差異表達蛋白,涉

及鐵死亡和T細胞毒性通路。m?Am測序確認Pcif1敲除使m?Am水平下降,影響特定靶點如Fth1

Slc3a2Cd69的蛋白表達,但mRNA水平不變,表明翻譯調控。PRMWBRIP實驗進一步證實

Pcif1通過m?Am修飾抑制這些蛋白的翻譯。盡管CTBP2在其他情境下參與m?Am調控,但在CD8+T

細胞中非必需。IP-MS分析發現Pcif1與蛋白質翻譯和mRNA加工相關因子相互作用。功能實驗表明,

Pcif1缺失使CD8+ T細胞鐵含量降低、GSH和胱氨酸水平升高,增強對鐵死亡誘導劑的抵抗力,主要

通過上調Fth1Slc3a2等基因的蛋白表達實現。綜上研究結果表明,Pcif1缺失主要通過增強Fth1

Slc3a2等鐵死亡調控基因的表達來減少CD8+T細胞的鐵死亡。


image.png

 

5)       Pcif1 缺乏可增強 PD-1 阻斷和 CAR-T 細胞療法的效果

研究發現,T細胞中Pcif1的缺失通過抑制鐵死亡并增強CD8+ T細胞的激活,顯著提升了抗腫瘤免疫應答。

在小鼠模型中,Pcif1條件性敲除小鼠的腫瘤對抗PD-1免疫治療的敏感性顯著增強,表現為腫瘤生長抑制、

生存期延長及腫瘤浸潤CD8+T細胞增多。進一步研究表明,Pcif1缺失通過m?Am甲基轉移酶活性調控Fth1

Slc3a2等基因的翻譯,減少鐵死亡并增強T細胞效應功能。在CAR-T細胞治療中,Pcif1敲除的CD8+CAR-T

細胞(尤其是靶向CD19CAR-T)在LLC-hCD19MC38-hCD19等腫瘤模型中表現出更強的抑瘤活性,

其機制與鐵死亡抑制及效應因子IFNγTNFGzmb分泌增加相關。挽救實驗證實,下調Fth1Slc3a2可逆轉

Pcif1敲除CAR-T細胞的鐵死亡特征并減弱其抗腫瘤效果,表明Pcif1通過調控鐵死亡通路增強CD8+T細胞功能。image.png 

6)       細胞中PCIF1 的低表達可增強對 ICI  CAR-T 療法的敏感性

研究人員發現,黑色素瘤患者腫瘤浸潤CD8+T細胞中PCIF1低表達提示對ICI治療反應更佳;B細胞

惡性腫瘤患者治療前T細胞PCIF1低表達者接受抗CD19 CAR-T治療后生存期顯著延長;口腔鱗狀細胞

癌患者中,抗PD-1治療應答者的淋巴細胞浸潤區PCIF1表達顯著低于無應答者,且其腫瘤微環境中

CD8+T細胞和GzmB陽性細胞顯著增多。PCIF1通過調控腫瘤微環境中浸潤性細胞毒性CD8+T細胞數量

影響免疫治療效果。


image.png

 

三、         結論

該項研究揭示了PCIF1通過m6Am修飾調控CD8+T細胞活化和鐵死亡的分子機制,并證明了PCIF1敲除能夠

顯著增強抗腫瘤免疫反應和免疫療法的效果。這一發現不僅為理解表觀轉錄組在免疫調控中的作用提供了

新視角,還為開發新型癌癥免疫療法提供了重要的理論依據和潛在靶點。未來的研究將進一步探索PCIF1

的臨床應用價值,推動免疫療法在癌癥治療中的突破。

參考文獻

Xiang, B., Zhang, M., Li, K. et al. The epitranscriptional factor PCIF1 orchestrates CD8 T cell ferroptosis and activation to control antitumor

 immunity. Nat Immunol 26, 252–264 (2025). 

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