樣品特性

• 樣品量

• 若樣品量充足，如進行大量蛋白質粗提物的分析，需要上樣較大體積樣品，可選擇齒深較深的梳子，以容納足夠的樣品。

• 對于微量樣品，如 DNA 樣本或少量細胞裂解后的蛋白質樣品，淺齒梳子即可滿足需求，避免因加樣孔過大導致樣品分散。

• 樣品分子量

• 分離高分子量的 DNA 或蛋白質時，深齒梳子提供的分離空間更有利于大分子的遷移，減少空間位阻，使分離效果更好。例如在脈沖場凝膠電泳分離超大分子量 DNA 時，常使用深齒梳子。

• 對于小分子量的樣品，如短片段 DNA 或低分子量蛋白質，淺齒梳子能限制樣品擴散，使條帶更清晰，便于準確分析，如在 DNA 測序實驗中，一般選擇淺齒梳子。

實驗目的

• 定性分析

• 若是進行簡單的樣品存在性檢測或粗略的條帶觀察，對條帶的精確性要求不高，深齒梳子和淺齒梳子都可使用。但如果樣品量少，淺齒梳子更合適；若要同時檢測多個樣品且樣品量充足，深齒梳子可提高效率。

• 定量分析

• 進行精確的定量分析，如測定蛋白質的表達量或 DNA 的濃度，需要條帶清晰、準確，此時淺齒梳子更為合適，它能提供更準確的條帶位置和形態，有利于后續的圖像分析和數據處理。

儀器設備

• 電泳槽規格

• 小型電泳槽由于凝膠面積和厚度有限，通常適合搭配淺齒梳子，以避免梳子過大對凝膠造成損傷，同時也能保證電場的均勻性。

• 大型電泳槽凝膠面積大、厚度厚，可選擇深齒梳子，充分利用凝膠的分離空間，同時也能適應較大的上樣量需求。

凝膠類型與厚度

• 凝膠類型

• 對于聚丙烯酰胺凝膠，因其孔徑較小，分離效果好，常使用淺齒梳子，有助于獲得清晰的條帶。例如在蛋白質的 SDS - PAGE 電泳中，一般采用淺齒梳子。

• 瓊脂糖凝膠孔徑較大，適合分離較大分子量的物質，可根據樣品量和分離要求選擇齒深合適的梳子。如果是分離大片段 DNA，可能深齒梳子更合適；對于小片段 DNA 的常規檢測，淺齒梳子即可。

• 凝膠厚度

• 較厚的凝膠可以承受更深的加樣孔，適合使用深齒梳子，能夠容納更多樣品，同時也能保證凝膠在電泳過程中的穩定性。

• 薄凝膠則適合淺齒梳子，減少對凝膠結構的破壞，防止在電泳過程中出現凝膠破裂或條帶變形等問題